Hàng năm, trường THPT Chuyên tổ chức nhiều hoạt động ngoại khóa thường niên: Hội thi dân vũ, hoạt động chào mừng khóa mới (12-Hour Challenge)[5], ngày lễ Tri ân cho học sinh ra trường,...

Các câu lạc bộ trong trường hiện đang hoạt động tương đối sôi nổi, là nơi để các bạn học sinh phát triển các kĩ năng của bản thân: CLB sách (The Book Circle), CLB tranh biện (CTN Debate), CLB tiếng Anh (UEE), CLB Nắng, CLB nhảy (CTN Dance), CLB âm nhạc (CTN Music),...

Trong năm học, một vài khối Chuyên và các câu lạc bộ trong trường cũng tổ chức các chuyến đi thiện nguyện tới các điểm trường ở vùng sâu vùng xa trên địa bàn tỉnh Thái Nguyên như Võ Nhai, Đại Từ, Đồng Hỷ,...

Các bạn học sinh của trường tích cực tham gia những hoạt động thể thao. Giải bóng đá tranh cúp CTN là một hoạt động được nhà trường tổ chức để nâng cao tinh thần thể thao, các học sinh sẽ phân đội và chia thành 2 nhóm giải: Giải đấu cho nam và cho nữ. Trong trường còn có CLB bóng rổ, bóng chuyền và cầu lông. Ngoài ra những cá nhân xuất sắc về các môn thể thao khác như: bóng bàn, bơi, cờ vua,... cũng được tuyển chọn để tham gia Hội khỏe Phù Đổng và các cuộc thi thể thao của tỉnh.